Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm4950D3YUM8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm4950D3YUM8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm4950D3YUM8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm4950D3YUM8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm4950D3YUM8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm4950D3YUM8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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