Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nxpe3B9EKK6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms