Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clip3B9EHT4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms