Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppfia4B8QI36 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia4B8QI36 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms