Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfia1B2RXQ2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfia1B2RXQ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms