Protein–RNA interactions for Protein: B2RWS6

Ep300, Histone acetyltransferase p300, mousemouse

Predictions only

Length 2,412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep300B2RWS6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ep300B2RWS6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep300B2RWS6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep300B2RWS6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep300B2RWS6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep300B2RWS6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep300B2RWS6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep300B2RWS6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep300B2RWS6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep300B2RWS6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep300B2RWS6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep300B2RWS6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms