Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clrn2B2RVW2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms