Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms