Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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