Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC035947B2RQY6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC035947B2RQY6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC035947B2RQY6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BC035947B2RQY6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC035947B2RQY6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC035947B2RQY6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC035947B2RQY6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC035947B2RQY6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BC035947B2RQY6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BC035947B2RQY6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BC035947B2RQY6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms