Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CK137956B1AYM9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms