Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms