Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf25B1AWN9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf25B1AWN9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms