Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr2B1AVP0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170 ms