Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scml2B1AVB3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms