Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms