Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700084M14RikB1AT01 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms