Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prr29B1ARI9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms