Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slfn8B1ARD8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slfn8B1ARD8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slfn8B1ARD8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slfn8B1ARD8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slfn8B1ARD8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slfn8B1ARD8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms