Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Supt3B0QZW4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms