Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Odf2A3KGV1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms