Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms