Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samt1A2BED8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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