Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Patl2A2ARM1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Patl2A2ARM1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms