Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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