Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc163A2AGD7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms