Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2dnl1A2AFH1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2dnl1A2AFH1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms