Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef6A2A8M8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef6A2A8M8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef6A2A8M8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef6A2A8M8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef6A2A8M8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef6A2A8M8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef6A2A8M8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef6A2A8M8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef6A2A8M8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef6A2A8M8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef6A2A8M8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms