Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Krtap29-1A2A5X4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms