Protein–RNA interactions for Protein: A2A580

1700025C18Rik, MCG1027936, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025C18RikA2A580 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms