Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSK3

Lnp1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnp1A0A1B0GSK3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnp1A0A1B0GSK3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnp1A0A1B0GSK3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnp1A0A1B0GSK3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnp1A0A1B0GSK3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnp1A0A1B0GSK3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms