Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms