Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms