Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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