Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Traf3ip1Q149C2 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms