Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TtrP07309 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TtrP07309 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TtrP07309 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TtrP07309 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TtrP07309 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Tmsb15a-202ENSMUST00000113154 544 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm11546-201ENSMUST00000120297 354 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm31363-201ENSMUST00000199362 541 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TtrP07309 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms