Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Mefv-201ENSMUST00000023180 3126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm8512-201ENSMUST00000215367 471 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Lcn2-201ENSMUST00000050785 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 1700024J04Rik-201ENSMUST00000093146 1821 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm12834-201ENSMUST00000121855 2829 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Igkv12-89-201ENSMUST00000103335 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm43012-201ENSMUST00000198569 937 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Lipa-202ENSMUST00000178114 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms