Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rrn3B2RS91 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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