Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Olfr170-202ENSMUST00000206562 1417 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Spag8-201ENSMUST00000084646 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Zfp410-203ENSMUST00000220931 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Teddm2-201ENSMUST00000059607 1654 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Olfr411-203ENSMUST00000214769 2545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Lrrc43Q3V0L5 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Lrrc43Q3V0L5 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Ttyh1-206ENSMUST00000129423 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Tusc5-201ENSMUST00000062024 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Caps2-203ENSMUST00000170013 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Reg3a-201ENSMUST00000101272 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Lrrc43Q3V0L5 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Lrrc43Q3V0L5 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Lrrc43Q3V0L5 Gtf2a1-201ENSMUST00000021345 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Lrrc43Q3V0L5 Slc25a44-201ENSMUST00000057935 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 1700020I14Rik-202ENSMUST00000153581 8300 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Patj-207ENSMUST00000107034 4799 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Zfp169-201ENSMUST00000110110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Crbn-201ENSMUST00000013882 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms