Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms