Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprkP35822 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Tfcp2l1-201ENSMUST00000027629 9269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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