Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm8171-201ENSMUST00000217443 720 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cd28P31041 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm24335-201ENSMUST00000104211 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Gm14225-201ENSMUST00000142310 539 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Cd28P31041 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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