Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 4930578I07Rik-201ENSMUST00000193416 1372 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm46995-201ENSMUST00000223445 1378 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm26209-201ENSMUST00000103852 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm23127-201ENSMUST00000104261 130 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Fam166b-202ENSMUST00000107928 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Inca1-204ENSMUST00000108543 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Parp11-204ENSMUST00000112195 733 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm12142-201ENSMUST00000117114 485 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm15572-201ENSMUST00000119248 593 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm12312-201ENSMUST00000120351 644 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm16031-201ENSMUST00000153253 448 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm22484-201ENSMUST00000157992 306 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 AF067061-202ENSMUST00000181748 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm20936-201ENSMUST00000191049 658 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm29068-201ENSMUST00000191607 400 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm37282-201ENSMUST00000191987 164 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm37665-201ENSMUST00000192353 149 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm43835-201ENSMUST00000195932 149 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm43535-201ENSMUST00000197846 164 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 1700021F13Rik-202ENSMUST00000202665 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm44379-201ENSMUST00000204501 164 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm44268-201ENSMUST00000204814 164 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 AC167202.2-201ENSMUST00000220155 296 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 AC134917.3-201ENSMUST00000222057 1283 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gnpnat1-202ENSMUST00000226276 710 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 AC164879.1-201ENSMUST00000227904 1021 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Olfr1388-201ENSMUST00000055584 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Svs3b-201ENSMUST00000063132 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Homer1-201ENSMUST00000060490 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Spin2c-201ENSMUST00000049999 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms