Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rrn3B2RS91 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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