Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Lrif1Q8CDD9 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Lrif1Q8CDD9 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Lrif1Q8CDD9 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms