Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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