Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Trav22-201ENSMUST00000198117 346 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ttc29Q80VM3 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ttc29Q80VM3 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc29Q80VM3 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms