Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ccdc18Q640L5 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ccdc18Q640L5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Lhfpl2-202ENSMUST00000118195 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Casp14-202ENSMUST00000219237 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ccdc18Q640L5 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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