Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2bQ01097 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms