Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
H2-Eb1P04230 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms